Türkşeker'in 15. fabrikası olarak bilinen Malatya Şeker Fabrikası'nın temeli, Aralık 1954'te atıldı. Fransız Fıves-Lille firması ve Eskişehir Şeker Fabrikası'nın ortak çalışmasıyla tamamlanan fabrika, 1 Ekim 1956'da dönemin Başbakanı Adnan Menderes tarafından resmen açıldı. İlk kurulduğunda günlük 1.200 ton pancar işleme kapasitesine sahip olan tesis, 1975-1976 yıllarındaki genişletme çalışmalarıyla bu kapasitesini 3.600 tona çıkardı. Bugün ise günlük 3.800 ton pancar işleme gücüne ulaşmış durumda.
Çevreye duyarlı bir yaklaşımla üretim yapan Malatya Şeker Fabrikası, mikrobiyolojik arıtım tesisi ve doğalgaz enerjisi kullanarak sürdürülebilir bir model benimsiyor. Fabrika, Malatya ekonomisine yıllık ortalama 400 milyon lira, ülke ekonomisine ise 500 milyon lira değer katıyor. Yıllık ortalama 120 gün süren üretim dönemi boyunca günde 500 ton, yılda ise 60 bin ton şeker üretiyor.
Sahip olduğu "Helal Gıda" ve "Gıda Güvenlik Sistemi Sertifikasyonu FSSC 22000" belgeleriyle de ürün kalitesini ve güvenilirliğini kanıtlayan Malatya Şeker Fabrikası, şehrin ekonomik kalkınmasında kilit bir rol oynamaya devam ediyor.