Kariyerinde daha önce Braga, Gil Vicente, Legia Varşova ve Benevento takımlarında forma giyen Guilherme, 19 Temmuz 2019’da Yeni Malatyaspor’a imza attı.
4’ü Avrupa Ligi ön elemeleri, 48’i Süper Lig ve 9’u Türkiye Kupası olmak üzere 61 karşılaşmada Yeni Malatyaspor’un formasını giyen Guilherme Costa Marques, bu karşılaşmalarda 12 gol kaydederken, 13’te asist yaptı.
Türkiye’de Yeni Malatyaspor’un ardından Trabzonspor ve Göztepe’nin de formalarını giyen Brezilyalı on numara, Süper Lig’de 74 maçta süre aldı.
Göztepe’den ayrıldıktan sonra Çin ekibi GZ City ile anlaşan Guilherme, 31 Mart 2023’te Brezilya ekibi Goias’a transfer oldu. Goias’tan yeniden Çin’e dönen ve CC Yatai takımı ile anlaşan Guilherme Costa Marques, 28 Haziran’da bir başka Çin ekibi Changchun Yatai Reserves ile anlaştı.
Changchun Yatai Reserves ile 2025 yılına kadar sözleşme imzalayan Guilherme’nin güncel piyasa değeri 650 bin Euro. Brezilyalı on numaranın piyasa değeri Yeni Malatyaspor’da oynadığı dönemde 4 milyon Euro’ydu.
Yeni Malatyaspor’daki ayrılığı olay olan ve sonrasında Trabzonspor ile anlaşan 34 yaşındaki Brezilyalı son olarak Changchun Yatai Reserves takımının formasını giydi. Brezilyalı oyuncu Çin ekibinin ardından kulüpsüz kaldı.
Guilherme, kariyerinde en çok Legia Varşova takımının formasını giydi. Varşova formasıyla 150 maça çıkan Brezilyalı on numara 21 gol kaydederken, 23’te asist yaptı.